甜椒的品種很多，其貯藏性差異也很大。一般抗病性強(qiáng)、果肉厚、色深綠的品種較耐貯藏，如：牟農(nóng)1號(hào)、茄門(mén)、二豬嘴、麻辣三道筋、冀較1號(hào)及巴彥等。同一品種中未著色的較已著色的耐貯藏。栽培中的肥水管理及病蟲(chóng)害防治等措施直接影響著甜椒貯藏期的長(zhǎng)短，用于貯藏的甜椒在栽培中應(yīng)避免偏施氮肥，注意多施有機(jī)肥和復(fù)合肥料。為了減少貯藏中的病害，可在采收前10～15天噴施殺菌劑。
    甜椒和黃瓜、番茄、茄子等果菜類一樣對(duì)低溫很敏感。在7.5℃以下貯藏時(shí)易受冷害，13℃以上貯藏時(shí)又會(huì)加速衰老和腐爛。甜椒的適宜貯藏溫度為9～12℃，適宜相對(duì)濕度為90%～95％。氣調(diào)貯藏的適宜條件為氧氣濃度2％～8％，二氧化碳濃度1％～2％。
1．砂藏   
    在窖內(nèi)或室內(nèi)的地面上(或木箱、筐內(nèi))鋪8厘米左右厚的砂子，上面擺經(jīng)挑選的甜椒，如此一層砂子，一層甜椒，可貯藏3～5層。以后10～15天翻動(dòng)一次，挑除不良果。注意將窖內(nèi)或室內(nèi)溫度控制在1O℃左右。
2．溝藏
    華北、東北和西北地區(qū)常采用溝藏方式。選陰涼通風(fēng)處挖寬1米左右，深l～2米的東西溝，長(zhǎng)度視貯藏量而定。先在溝底鋪8厘米左右的砂子，然后堆放經(jīng)挑選的甜椒約30厘米厚。也可將甜椒裝筐后置入溝內(nèi)或用砂子、稻殼等層積。貯藏前期注意防熱，每15天左右檢查一次；天氣寒冷后視溫度變化分次覆土或覆蓋草簾等防寒物。此外還要嚴(yán)防雨雪進(jìn)入溝內(nèi)。
3．窖藏
    選地勢(shì)高的場(chǎng)所，挖深1米、長(zhǎng)5～6米、寬3米的地窖，將四周墻壁拍堅(jiān)實(shí)。用磚將窖底鋪好，窖口以塑料薄膜或蘆席作蓋，防止雨淋或凍害。由于甜椒適宜貯藏溫度較高，蒸發(fā)量較小，故窖的保溫性能要好，一般不設(shè)進(jìn)氣孔，僅在窖頂設(shè)有通風(fēng)窗。甜椒在窖內(nèi)的貯藏形式，可因地制宜采用筐貯、架藏和散堆等方式。
4．簡(jiǎn)易氣調(diào)貯藏
    ①小袋包裝貯藏：將1.5～2千克的甜椒裝人厚度為0.02～0.03毫米的聚乙烯塑料薄膜中，扎緊口袋，裝筐或直接放在架子上。這種方法可以和土窖、通風(fēng)窖和冷庫(kù)等不同貯藏設(shè)施相結(jié)合。
    ②大袋包裝貯藏：在籮筐或箱內(nèi)鋪塑料薄膜，然后裝入10千克左右的帶2厘米長(zhǎng)果梗的甜椒，將薄膜向里折合包住甜椒。貯藏一定期間后由果梗部開(kāi)始變色、腐爛，用剪刀剪去果梗部后即可出售。