DGGE法分析PCR產(chǎn)物,如果突變發(fā)生在最先解鏈的DNA區(qū)域,檢出率可達100%,檢測片段可達1kb,最適圍為100bp-500bp;驹砘诋旊p鏈DNA在變性梯度凝膠中進行到與DNA變性濕度一致的凝膠位置時,DNA發(fā)生部分解鏈,電泳適移率下降,當解鏈的DNA鏈中有一個堿基改變時,會在不同的時間發(fā)生解鏈,因影響電泳速度變化的程而被分離。由于本法是利用溫度和梯度凝膠遷移率來檢測,需要一套專用的電泳裝置,合成的PCR引物最好在5`末端加一段40bp-50bp的GC夾,以利于檢測發(fā)生于高熔點區(qū)的突變。在DGGE的基礎(chǔ)上,又發(fā)展了用濕度梯度代替化學變性劑的TGGE法(溫度梯度凝膠電泳temperature gradient gelelectrophoresis,TGGE)。DGGE和TGGE均有商品化的電泳裝置,該法一經(jīng)建立,操作也較簡便,適合于大樣本的檢測篩選。