在水產養(yǎng)殖方面應用體系，就是要在親體-幼苗-養(yǎng)成-銷售整個過程中對包括養(yǎng)殖場在周圍環(huán)境、養(yǎng)殖水質、苗種、飼料、水產藥物等方面 進行全方位的監(jiān)控，針對各個重要的環(huán)節(jié)進行危害分析，并加以控制，確保養(yǎng)殖產品不會人類的健康造成危害。

    1、對養(yǎng)殖場周圍環(huán)境的控制。對養(yǎng)殖場的選址、設計和建造必須認真進行，其危害可能出現(xiàn)在養(yǎng)殖場周圍環(huán)境中，有無物理、化學、放射性等污染源與之息息相關。土壤的特性與建造在該地的池塘的水質直接有聯(lián)系，如酸性土壤會使PH降低，從而使析出的金屬在水體中富集。如果池塘與農田或工礦區(qū)相連，殺蟲劑或其它化學物質必然會進入池塘，引起對魚體的化學污染。要做好這方面的控制，就要求池塘地理位置適宜，遠離有毒有害場所及污染源。

    2、養(yǎng)殖水質的監(jiān)控。水源的選擇和水質的處理都是養(yǎng)殖水質監(jiān)控的重點。養(yǎng)殖的水源是健康養(yǎng)殖的關鍵前題。工業(yè)、農田及居住區(qū)的廢水排放，都可能帶來過量的重金屬、農藥、病毒細菌等，為此，水產養(yǎng)殖場要遠離工業(yè)、農田及居住區(qū)，以避免水源受到污染。池塘的水質應該滿足漁業(yè)用水標準，要水質清新，不能含有過量的對人體有害的重金屬及化學物質，池塘的底泥及周圍土壤中的重金屬含量指標不超標。。日常的管理中，應每 天都對養(yǎng)殖水體測定其溫度、PH值、溶解氧、氨氮、硫化物等污染指標。通過水質分析和對底質的污染指標的監(jiān)測，從而測出污染物的組成、變化及遷移的情況。以上監(jiān)控都要建立糾編和驗證程序，并保存記錄。國家頒布了NY 5051-2001《無公害食品 淡水養(yǎng)殖用水水質》的行業(yè)標準，其標準可作為檢測、評價養(yǎng)殖水體是否符合無公害水產品養(yǎng)殖環(huán)境條件要求的依據(jù)。

    3、苗種安全的控制。育苗場在育苗過程中要禁用抗生素、孔雀石綠等藥物，避免高溫育苗、有親源關系的親本繁殖。育苗場中在育苗過程中使用對餌料、藥物、水質處理都要有嚴格的控制，必須做好控制和糾編的記錄。在苗種的放養(yǎng)上，要求選擇規(guī)格一致、無病害、無傷殘的優(yōu)良苗種。

    4、在飼養(yǎng)管理上的控制。投喂用料是否安全、防病用藥是否適宜都是飼養(yǎng)管理中的重點環(huán)節(jié)。在投喂用料方面，國家頒布了NY 5072-2001《無公害食品 漁用配合飼料安全限量》的行業(yè)標準。由于飼料的安全性直接影響到養(yǎng)殖水產品的安全性，為此飼料生產企業(yè)須經把好原料采購、配方、加工操作等關。不能用鎮(zhèn)靜類、激素類等被限用或禁用的藥物作添加劑。在包裝上必須做到包裝規(guī)范，要有具體的飼料型號。貯存飼料的場所要干燥、通風，做好防鼠防蟲工作，注意保質期。每個養(yǎng)殖場都應建立飼料投喂、魚藥添加、飼料轉換等記錄保持程序，萬一不小心用了不合格的飼料，可采用轉移魚群或延長凈化時間的方法來處理。在防病用藥方面，國家頒布了NY 5071-2001《無公害食品 漁用藥物使用準則》的行業(yè)標準，根據(jù)此規(guī)定，重金屬鹽類、磺胺類、激素類、鎮(zhèn)靜劑類等藥物中有許多屬于限量使用或禁止使用。目前市場上的漁藥種類繁多，有許多是沒標明藥物成分和含量的，很容易造成藥物的非法使用，養(yǎng)殖者在購買漁藥時一定要選擇有藥物成分和含量及生產批號的藥物。養(yǎng)殖者應避免選用高毒、高殘留的漁藥，多選用中草藥或微生物制劑、水質改良劑等生態(tài)形高效低殘留藥物。在養(yǎng)殖場中要有專門的場所用來貯存藥物，此場所要做到干燥、通風，不能給陽光直曬。對于用藥的原因、種類、停藥期、用藥人等都應有完整的記錄，貫徹實?quot;全面預防，防重于治的方針。

    在正確的養(yǎng)殖管理中應用HACCP必定能提高水產品的食用安全性，確保水產養(yǎng)殖產品無公害化、綠色化、環(huán)保化，使其能順利進入國際市場，給養(yǎng)殖者帶來更大的經濟利益。